Cygwin - эмулятор UNIX для Windows, позволяющий использовать большинство *nix-утилит (практически все). Работать можно как из графической оболочки, так и из командной строки.

L0phtCrack - знаменитый инструмент для аудита и взлома паролей. Поддерживаются как 32-битные, так и 64-битные системы, причем не только Windows, но и другие, например, Ubuntu и т.д. и т.п.

Total Commander - популярный файловый менеджер с практически всеми необходимыми для таких программ функциями.